2008选举前，台湾“中研院”在陈水扁老家附近的麻豆镇水堀头进行的考古工作，挖掘出一完整马匹遗骸。因地方人士指水堀头是龙穴，出天子，即认为“龙穴现马”是个征兆，马英九可能当选台湾地区领导人，但怕影响选情而不愿声张。322开票，马英九果然当选，消息才传开。
据台《苹果日报》报道，去年因台当局开辟玉井到北门段东西向快速道路，恐破坏古文物遗址，“县府委”由“中研院”历史语言所教授刘益昌，率考古队进行挖掘工作，至今已挖出不少文物，包括罕见的台湾新石器时代晚期的青铜箭头、来自大陆的青花瓷及平埔族人所喜爱的玛瑙饰品等。
考古队成员指出，今年春节后，队员在紧邻致远管理学院南侧凤池考古区内工作时，第一次在地表一公尺下挖出一完整的马匹遗骸，“犹如刻意保留下来一般。”队员表示，过去经常发现狗、猪、牛的遗骸，但都不完整。
考古队员表示，出土的马匹遗骸，是一只侧躺状的全马骨骸，鼻子附近有金属扣环，背有类似马鞍的褐色粉状物，肚子还有类植物性粉状物，应是马当时肚子里的食物。
台南县文化处长叶泽山指出，经找学者专家了解，研判水堀头因日趋干涸成为沼泽时，这匹马不慎跌落死亡；但也有人认为可能是马主人厚葬在当地，若说龙穴出马骨，马英九就因此当选台湾地区领导人，未免穿凿附会。不过台南风水师圣骅居士认为马与狗、猪都是堵塞龙穴的陪葬物，但因马骨完整，还是有关系。
考古队发现马遗骸后，立即向台南县政府文化处呈报，但台南县政府却一直未对外发表，地方有人耳闻后都暗中议论“会不会马将当选台湾地区领导人。”但担心会影响选情，都不愿声张。结果2008选举结果出炉，马英九当选，消息才传开来，台南县政府也证实确挖出全马遗骸。文旦果农姜丁灿感慨说：“这不就代表龙穴被马占据了？这对麻豆镇民来说，不知是福是祸！”
考古队目前用帆步盖住马遗骸，也进行初步防霉处理，四周并以铁篱笆封住，禁止外人接近。县文化处人员表示，工程预计今年五月可完工。
