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随着“非典”病毒在世界的肆虐，日本采取了非常严密的戒备措施，不仅医院加强了隔离制度，连从疫区回国的中小学生也被规定在家隔离10天确认没有异常症状后方可入学，目的是堵住病毒登陆日本和在日扩散的所有渠道。
5月6日，日本厚生劳动省指示全国所有的医疗机构，遇有流感病人到达医院时医院须采取措施，将患者引导到隔离室隔离，避免患者与其他病人和医务人员接触而引发院内感染。直至患者被排除“非典”之前，病人还需佩戴口罩。此前日本有关部门已经规定，觉察到有“非典”症状的患者必须事先与医院电话联系，根据医院的安排和指示接受治疗。日本公布的诊断初期“非典”患者的根据主要包括高烧38摄氏度以上，伴有咳嗽、呼吸困难，发病前10天之内到过疫区的人员等。但是有些病人不认为自己患“非典”，而自认为得了感冒或流感时，会自己到医院就诊。日本政府这一决定的目的是为防止任何可能引起医院传染的渠道。
7日，东京都教育厅也作出规定，从“非典”疫区回到日本的儿童、学生和教职员工，即便没有感染症状，也必须在家隔离10天，确认没有异常症状并经校医认可后方可入学上课。目的是隔绝校内传染的可能性。
至今日本国内尚未发现“非典”感染者，但“五一”黄金周期间，大批日本职员及其子女从疫区回国，引起了日本国内的警惕。个别地方小学因拒绝回国学生入学上课，引起了社会矛盾。因此日本政府开始制定统一的预防规则。
另据报道，日前日本首相小泉纯一郎指示厚生劳动大臣坂口力，为帮助中国治疗“非典”应进一步增加对华医疗援助和技术支援。日本有关部门正就援助我国诊断用医疗设备、人工呼吸机、运输车辆和派遣医疗技术人员等进行内部协调。4月底日本政府曾经向我国提供两亿日元的紧急物资援助。
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