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卫生部决定于6月上旬和中旬在全国范围内开展传染病防治工作执法检查活动，重点检查疫情报告制度的落实情况、传染源流行病学追踪调查以及传染病隔离消毒措施执行情况。卫生部警告对检查工作走过场、敷衍了事的地区，一经发现，卫生部将进行通报，并建议当地政府或者有关部门严肃处理相关责任人员。
为全面贯彻落实党中央、国务院关于传染性非典型肺炎防治工作的部署要求，加强传染病防治工作，根据《中华人民共和国传染病防治法》及实施办法、《突发公共卫生事件应急条例》《传染性非典型肺炎防治管理办法》等法律、法规和规章，卫生部将进行这次执法检查。
在4日布置这次执法检查的电视电话会上，卫生部副部长马晓伟告诫各地要认清当前非典防治形势，增强紧迫感。他表示，近些天全国新增报告病例持续下降，疫情趋于平缓。但是，目前全国防治任务仍十分艰巨。少数地区仍有新发病例出现，重点地区新发病例下降的持续时间还很短，防止疫情反复的警惕性一刻也不能放松。
从本次非典疫情暴发流行暴露出来的问题看，卫生系统内部在疫情报告、传染源追踪、密切接触者流行病学调查和隔离等关键防治环节还存在不规范、不到位、工作不够深入等问题。有的地方疾病监测与疫情报告体系不顺，信息不灵；非典以外的其他传染病疫情缓报、漏报情况仍然存在。这些问题如果不及时纠正，都将构成传染病流行、暴发的严重隐患。
因此，卫生部要求各地卫生行政部门在本次执法检查中，要认真找出问题，切实落实整改措施。到被检查单位不仅要听介绍，更要实地进行核实，掌握第一手资料。要深入医疗卫生机构传染病防治工作第一线了解实际情况，帮助查问题、找原因、建机制。对发现的严重违法行为，决不姑息。对涉嫌触犯刑律的，要及时移送司法机关处理。
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