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国家审计署对17个省(区、市)35个地(市)的788户企业税收征管的重点抽查表明：这些企业2002年少缴税款133亿元，2003年1至9月少缴税款118亿元，少征税款的80%左右是由税务机关人为调节造成的。
国家审计署署长李金华23日向正在召开的十届全国人大常委会第十次会议作《关于2003年度中央预算执行和其他财政收支的审计工作报告》时说，许多地方税务部门存在人为调节税收进度的问题，一些税务部门在完成税收计划的情况下，有税不征、违规缓征，甚至违规退库或利用税款过渡户人为调节收入。
抽查表明：788户企业中有近一半的企业存在这类问题，由此造成2002年底和2003年9月底分别少征税款106亿元和102亿元。
他说，有些税务机关征管不力，也是造成税收流失的重要原因。有些税务机关对企业纳税申报审核不严，擅自扩大优惠政策执行范围，违规批准减免税，导致税收流失27.6亿元，涉及企业169户，占调查企业户数的21%。
审计机关还发现，个别税务机关严重失职渎职，造成国家税款大量流失。调查显示，河南省许昌市地税部门对货运专用发票管理失控，向无货物运输业务的企业无限量发售专用发票。仅审计部门抽查的6户企业2001至2002年共代开、虚开货运发票1万多本，金额19.17亿元，从中收取手续费513万元。若这些发票全部抵扣，将造成1亿多元的增值税流失。
李金华说，此案经审计发现后，已移送涉嫌犯罪案件62起，抓获犯罪嫌疑人39人，追缴入库税款8687万元。当地税务机关73名责任人受到处分，2人被移送司法机关处理。
李金华表示，审计表明当前有些税收政策存在漏洞。例如，现行民政福利企业税收优惠政策虽然在鼓励残疾人就业方面发挥了一定作用，但国家付出的代价过高，残疾人得到的实惠较少。审计部门调查的10个地(市)共有民政福利企业6438户，2002年1月至2003年9月，享受税收返还和减免103.49亿元，而同期这些企业支付给残疾人的工资福利只有12.3亿元，大部分减免税成为企业的自有资金或被有关部门集中使用，违背了制定这项政策的初衷。
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