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大港区结合天津市生态功能区规划和本区特点，按照生态功能将大港区划分为四大生态功能区域，并将于2008年在全市率先达到生态区标准。
生物多样性保护功能区位于大港区中心地带，包括北大港水库、官港湖、钱圈水库、沙井子、独流减河等，范围基本覆盖北大港湿地自然保护区核心区的全部范围和部分，以及古贝壳堤自然保护区，面积355平方公里。
沿海滩涂与水产增殖生态功能区位于大港区南部和东部沿海，主要包括太平村、李二湾等淡水养殖区和海水养殖区以及沿海滩涂，面积约70平方公里。
城区及油田综合发展生态功能区主要包括北部的大港城区、东部新城、大学城、石化基地、三角地和南部的油田生活区和生产区，面积约150平方公里。该功能区基本分为三大类：生活功能区、教育功能区、工业生产区。
旱作和土壤盐碱化控制生态功能区包括太平镇、小王庄镇、赵连庄、港西街，独流减河以西、防洪大堤以西等，以及以上三大功能区未包括的区域，面积约539平方公里。
另外，大港区还在生态功能区划的基础上，对具有水源涵养、水土保持、水源保护、防风固沙、生物多样性保护等重要生态服务功能的区域确定为重要生态功能区，即：北大港湿地生物多样性保护重要生态功能区，海岸带和滩涂重要生态功能区。
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