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南开大学创办于1919年，创办人是著名爱国教育家张伯苓,(1876-1951)和严范孙(1860-1920)。
南开大学成立时，设文、理、商三科，招收学生96人，周恩来为文科第一期学生(学号62号)。1920年增设矿科(1926年停办)。1927年成立社会经济研究委员会(后改称经济研究所)和满蒙研究会(后改称东北研究会)，经济研究所趋重实地调查和以物价指数为主的经济统计工作，其出版的《经济周刊》、《南开指数年刊》等多为国内外学术界所借重。1929年改科为院，设有文学院、理学院、商学院及医预科，共13个系。1931年，商学院与文学院经济系及社会经济研究委员会合并成立经济学院；创办化学工程系和电机工程系，附属于理学院；1932年设立应用化学研究所。
早期的南开大学作为私立大学，其经费除政府少许补贴和学费及校产收入外，基本赖于基金团体和私人捐赠。本着“贵精不贵多，重质不重量”的原则以及投资所限，学校规模一直较小，1937年在校学生仅429人，但师资力量较强，凌冰(教育)、姜立夫、刘晋年(数学)、饶毓泰(物理)、邱宗岳、杨石先(化学)、李继侗、熊大仕(生物)、蒋廷(历史)、李济(人类学)、肖公权、徐谟(政治学)、何廉、方显廷、陈序经、李卓敏(经济)、黄钰生(心理学)、张彭春(教育学)、柳无忌(英文)、司徒月兰(英文)、冯文潜(哲学)、张克忠、张洪元(化工)等。竺可桢(气象、地理)、汤用彤(哲学)、范文澜(历史)、罗隆基(政治)、吴大猷(物理)等也都曾在南开短期任教。
经过长期的艰苦创业，南开大学终以优越的学术环境、严谨的科学训练方针以及崇尚务实的精神而名驰南北，为国家和民族培养了一批优秀人才，周恩来、陈省身、吴大猷、曹禺等是其杰出代表。
1937年7月，正处于成熟发展时期的南开大学不幸惨遭日本侵略军狂轰烂炸，三分之二的校舍被毁。同年8月，南开大学与北京大学、清华大学合组长沙临时大学，三校校长张伯苓、蒋梦麟、梅贻琦为常务委员，共主校务。翌年4月，长沙临时大学迁往昆明，改称西南联合大学。1939年南开经济研究所迁至重庆沙坪坝南开中学内，继续开展研究工作，并招收研究生；1942年7月，南开在昆明成立“边疆人文研究室”，并出版《边疆人文》刊物。联大期间，三校风云际会，艰苦创业，和衷共济，为国家民族培养了一大批杰出的科学人才和革命志士，谱写了中国教育史上的光辉篇章。
抗日战争胜利后，三校复员北归，1946年南开大学迁回天津并改为国立。复校后设文学院、理学院、政治经济学院和工学院，计16个系，另设有经济研究所、应用化学研究所及边疆人文研究室。师资力量有了加强，一批学者如吴大任、卞之琳、肖采瑜、傅筑夫、高振衡、李广田、罗大冈、汪德熙、谢国桢、张清常、王玉哲、杨生茂、司徒月兰等来校任教。张伯苓在担任校长长达30年之后，于1948年离任，由何廉代理校长。
1949年1月，天津解放，南开大学开始了新的历程。党和政府十分关心南开大学的发展，周恩来总理于1951年、1957年和1959年三次回母校视察；1958年毛泽东主席莅校视察；1994年江泽民总书记视察南开；李鹏、朱鎔基等也曾先后视察南开，党和国家领导人给南开师生以极大的鼓舞。
1952年全国高等学校院系调整，南开大学由一所学科比较齐全的大学变成了一所仅拥有文理学科的综合性大学，设有14个系，3个专修科。院系调整后，郑天挺、雷海宗、吴廷璆、李何林、朱维之、李霁野、季陶达、顾昌栋、温公颐、陈仁烈、江安才、曾鼎禾、杨宗磐调入南开；王赣愚、何炳林、陈荣悌、陈茹玉、陈天池、王积涛、严志达、崔等一批国外留学者纷纷回归，相继加入南开教席。1958年，南开大学的贸易、企业管理、会计、金融、财政、统计等系转入新组建的天津财经学院。1960年设立地质地理系(1961年停办)、物理二系(1961年转入兰州大学)和哲学系。80年代前，长期停滞于9个系的设置，即数学、物理、生物、化学、中文、外文、哲学、政治经济学、历史等系。
1966年至1976年，南开大学正常教学秩序被破坏。1966年至1971年教学、科研工作完全瘫痪，五年之久不招生、上课。1976年7月唐山大地震波及天津，学校大部分校舍遭到不同程度损坏。
改革开放以来，南开大学焕发青春活力。1980年以后，南开大学为适应社会主义现代化建设需要，利用老专业基础好的优势，建立了一批新的专业和研究机构。文科重点增设了以财经类为主的应用性专业，并在此基础上于1983年恢复了经济学院，理科重点增设了交叉、边缘和高新科技类专业。到80年代中后期，南开大学发展成为一所包括人文社会科学、自然科学、技术科学、生命科学、管理科学及艺术等多学科的综合大学。1994年，天津对外贸易学院并入南开大学。
继张伯苓之后，何廉、杨石先、臧伯平、滕维藻、母国光先后任南开大学校长，现任校长是侯自新。
南开大学是国家教育部直属重点综合性大学，是敬爱的周恩来总理的母校，历来受到党和国家的重视和关怀。毛泽东、周恩来、江泽民等党和国家领导人曾先后视察南开大学。毛泽东主席亲笔为南开大学题写校名，江泽民总书记为南开大学题词：
"发扬爱国敬业创新乐群的光荣传统，建设一流的社会主义大学"。
2000年12月25日，教育部和天津市人民政府签署重点共建南开大学协议，南开大学跻身21世纪国家重点建设大学行列。
南开大学创建于1919年，创办人是近代著名爱国教育家张伯苓和严修。抗日战争时期，南开大学与北京大学、清华大学在昆明组成举世闻名的西南联合大学，被誉为"学府北辰"。
南开大学学科门类齐全，形成了文理并重、基础宽厚、突出应用与创新的办学特色。建有17个专业学院(系)，设有研究生院、成人教育学院、职业技术学院、现代远程教育学院、泰达学院、经济社会发展研究院及体育教学部。有61个本科专业，115个硕士点，75个博士点，13个博士后科研流动站。有18个国家重点学科, 13个省市级重点学科，8个国家基础学科人才培养和科学研究基地以及1个文化素质教育基地，4个全国高校人文社会科学重点研究基地。
南开大学拥有一支阵容整齐、结构合理、学术精湛、锐意创新的师资队伍。在1472余名专任教师中，中国科学院院士和中国工程院院士7人，国务院学位委员会学科评议组成员9人，国家级有突出贡献的专家14人，"长江学者奖励计划"特聘教授9人，天津市特聘教授1人，国家杰出人才基金获得者10人，入选国家"百千万人才工程"资助计划教师9人，教育部跨世纪人才基金获得者26人，博士生指导教师355人，教授465人，副教授594人。
南开大学具备培养学士、硕士、博士及博士后的完整教育体系。现有各类学生27907余人，其中本科生10762人，专科生1144人，硕士研究生4406人，博士研究生1609人，留学生687人，成人教育在校生7681人，远程教育学生1608人。
南开大学有着广泛的国际影响，与美、日、英、法、德、俄等国家的一百多所大学和国际学术机构建立了合作与交流关系。数学大师陈省身在学校定居，身边汇聚了一大批国内外知名的数学人才，使南开大学成为国际数学重镇之一。诺贝尔奖获得者杨振宁、李政道、丁肇中以及美国前国务卿基辛格、韩国现任总统金大中等被聘为名誉教授，并有一批海内外知名学者、著名企业家任兼职教授。
南开大学校园占地1458694平方米，建筑面积900989平方米。学校有先进的仪器设备和丰富的图书资料。建有2个国家重点实验室，1个国家工程中心和4个教育部重点实验室。有中心实验室、计算中心、网络信息与教育技术管理中心及近百个教学实验室。有两个校级图书馆和多个专业图书馆，藏书总量达298.9万册。拥有在全国高校中具有一流水平的大型电子阅览室，建成了覆盖全校的计算机信息网络，并与Internet、中国教育科研网等主干网络联通，可随时查询、获取国内外最新学术信息。为方便学生的学习与生活，学校为学生宿舍的每个房间安装了直拔电话。与天津经济技术开发区合作建设的南开大学泰达学院于2000年9月投入使用，这里一流的设施和一流的管理为培养学生的实践创新能力提供了优越的环境。
南开大学既是教育教学中心，又是科学研究中心。在自然科学方面取得了一批国内外公认的研究成果，SCI论文数量居全国高校第7位，其中有机化学、农药化学、基础数学、应用数学和光学等领域都已达到国际先进水平，防伪识别等一批尖端高新技术的研究与开发为我国现代化建设作出了贡献。以南开戈德集团公司、南开允公集团公司为首的一批高新技术企业利用学校多学科综合优势，积极参与市场竞争，成为国家和地方高科技成果产业化的一支重要力量。南开大学国家大学科技园全新的管理模式和投资机制，为师生创业提供一流的环境和服务。南开大学人文社会科学研究在全国高校中处于前列。在历史、经济、管理、哲学、中文等学科领域均取得了一批具有较高学术水平与广泛社会影响的研究成果。APEC研究中心、经济社会发展研究院等研究机构成为国家部委和地方政府决策的"智囊团"和"人才库"。
南开大学以邓小平教育理论为指导，突出和加强学生全面素质和创新能力的培养，提出了"注重素质、培养能力、强化基础、拓宽专业、严格管理、保证质量"的教学指导思想，建立了完整的课堂教学、科学实验、学术活动和社会实践相结合的教学体系，实行学分制、主辅修制、双学位制，增强选课、转系转专业的灵活性。1999年，南开大学顺利通过教育部本科教学优秀学校评价，被评为教育部本科教学工作优秀学校。根据教育部和天津市政府重点共建协议精神，南开大学将本着"独立办学、紧密合作"的原则，与天津大学开展全面合作，通过教师互聘、学生互相选课、学分互认等方式，开拓学生的知识视野，强化学生的理论基础和实践创新能力。学校设有奖学金30余种，每年约有近半数学生从入校起即可享受到不同等级的奖学金，最高额度每年可达5000元。贷学金、困难补助、勤工助学以及社会各界人士的热心捐助为困难学生顺利完成学业提供了有力的保障。南开大学以优良校风著称，一贯重视学生德、智、体、美全面发展，为青年学子的健康成长营造了丰富高雅、活泼向上的校园文化氛围。南开毕业生以基础扎实、素质全面、富于开拓精神和实践能力而受到社会各界青睐。
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