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国防科技工业是国家战略性产业。大力推进国防科技工业发展，是“十一五”期间一项关系全局的重要任务。《建议》根据国内外形势的新变化，对国防科技工业的发展和改革提出明确的要求。
第一，国防科技工业的发展要适应新军事变革的要求。《建议》提出，要积极推进中国特色军事变革，努力提高军队信息化条件下防卫作战能力。根据这一要求，要对我国国防科技工业的发展作相应的调整，通过自主创新和引进技术，提高国防科技工业的技术含量，以增强高科技条件下的高新武器装备供给保障能力。
第二，国防科技工业发展要坚持军民结合、寓军于民的方针。这是指导新时期国防科技工业发展的基本方针。国防科技工业要继续调整改造和优化结构，同时要健全军民互动合作的协调机制，提高军民产品的研发和制造水平，以带动和提升整个产业技术水平。要按照“小核心、大协作、寓军于民”的要求，进一步调整和优化科研生产能力结构，把大力发展军工先进制造业摆在突出位置，着力提高军民产品的研发和制造水平。要加快军工高技术产业发展，壮大产业规模，在确保武器装备供给的同时，积极推动军民两用性强、军工具有比较优势的高技术实现产业化，培育新的经济增长点，带动国家产业结构优化升级。同时，要积极吸纳民用工业的先进技术，推动民用高科技向军工转移。通过加强军工民用技术的双向互转以及军民产业的互动合作，推动产业技术水平上新台阶。
第三，国防科技工业要以提高自主创新能力努力增强核心竞争力。必须通过改革加快形成有利于增强自主创新的体制和机制，实现“三个转变”，在发展理念上从跟踪发展向自主创新转变，在发展模式上从重产品轻基础向两者协调发展转变，在发展机制上从军民分割、封闭发展向二者协调发展转变。提高自主创新能力要突出重点，抓住关键：一是健全科技创新体系。要根据武器装备、民用产业和基础研发的不同需要，国防科技和基础研发以国家科研院所、研究型大学为主，企业为辅，民用产业以企业为主，实行产学研相结合。二是大力推进自主创新的基础能力发展，逐步构建体系合理、功能完备、技术先进、军民兼容、效率突出的科技基础条件平台。三是实施若干重大科技专项，培育具有自主知识产权的高新技术产业群。四是增强原始创新、集成创新和引进消化吸收再创新的能力。
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