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二、审计评价意见
审计结果表明，三峡总公司和各主要参建单位认真贯彻落实党中央、国务院的决策和部署，克服工程建设周期长、任务重、技术复杂等带来的各种困难，逐步建立健全各项内控制度，加强工程建设管理，不断探索创新，保证了工程建设的顺利进行。工程质量总体优良，工程建设总体进度有所提前，投资控制和建设资金管理使用情况较好，施工区环境保护措施基本落实，初步发挥的防洪、发电、航运等综合效益好于预期，初步设计报告确定的2009年工程基本完工和全面运营的目标能够实现。
(一)投资控制比较有效。
经测算，至2009年三峡工程基本竣工(除右岸地下电站和垂直升船机外)，尚需投资约140亿元，静态总投资可控制在概算确定的500.9亿元内，预计动态总投资为780多亿元，比1994年预测总投资减少350多亿元。主要原因：一是建设期间国内宏观经济环境较好，价差和利息支出比预期要减少300多亿元；二是国务院三峡建委和三峡总公司两个层次的投资控制机制比较有效，“静态控制、动态管理”的模式比较成功，对因物价、汇率变动而引起的投资增加实行逐年核定，累计实现投资结余14.2亿元。
(二)建设资金管理使用情况总体较好。
建设资金管理内控制度比较健全，会计核算和财务管理比较规范，未发现挪用和严重侵占建设资金的问题，三峡工程建设基金做到了专款专用。三峡工程与金沙江下游开发项目实行独立核算，避免了相互挤占。
(三)工程建设管理不断加强并逐步规范。
一是二、三期工程较好地执行了招投标制度，机电设备招标工作取得显著的经济效益和社会效益。抽查516个建筑安装合同，金额344.97亿元，招标合同(含公开招标和符合规定的邀请招标)占应招标合同的65%，金额占92.3%。在一、二、三期工程中，招标金额比率分别为71%、95.5%和88.2%。在左岸电站机组国际招标中，三峡总公司采取根据技术转让情况支付转让费等方式，使哈尔滨电机厂和东方电机厂在较短时间内掌握了大型水电机组设计与制造的核心技术和关键工艺，提升了我国水电行业整体技术水平和国际竞争力。在右岸电站12台机组招标中，这两家企业凭借自主创新形成的竞争能力，各承担了4台(套)水轮发电机组的设计制造任务。与进口机组相比(不含技术转让费、进口关税和增值税)，8台国产机组共节省投资3.56亿元。
二是对主要物资材料采购和质量管理比较严格。抽查40%的钢材、水泥等6种主要物资材料结果表明，三峡总公司通过采取业主供应制和较完整的质量检测制度，保证了物资材料供应的进度和质量，降低了采购成本，购进的物资材料质量总体较好。
(四)工程建设总体进度有所提前。
与初步设计报告规定的工期比较，2005年，左岸电站14台机组提前一年投入运营；2006年5月，右岸大坝提前半年浇筑到185米设计高程，大坝全线贯通；同年10月，提前一年蓄水至156米水位目标。除垂直升船机(因主体设计方案改变，推迟建成)和右岸地下电站(新增项目)外，右岸电站、电源电站、永久船闸完建和泄洪坝段导流底孔封堵等在建工程，都将在2009年前按期或提前建成运营。
(五)工程质量总体优良。
在满足国家标准和行业标准要求基础上，三峡总公司制定了110多个质量标准和关键部位、关键工序的施工技术标准，部分标准达到或超过了国际水平，有14项技术获国家科技进步一、二等奖。经国务院质量检查专家组评定，审计的11个主要单项工程质量全部合格，平均优良率达到87%。其中，一、二、三期单元工程优良率分别为79.2%、80.7%和92.3%。
(六)施工区环境保护措施基本落实。
施工区环境质量得到较好控制，目前施工区段的长江干流水质保持在Ⅱ-Ⅲ类标准，生活水厂的水源水质符合饮用水卫生标准；大气环境质量较好；治理水土流失取得一定成效，已投入5.6亿元，完成和正在实施的绿化面积约140万平方米，绿化道路34.7公里。
(七)初步发挥的综合效益达到或超过预期目标。
一是防洪效益初步显现。2003至2005年围堰发电期间，出现过一次流量大于每秒5万立方米的洪水。在该次洪水调度中，经国家防汛总指挥部批准，三峡水库水位上升至136.43米，蓄洪量为5亿立方米，确保了机组安全发电，也减轻了下游的防洪压力。2006年6月大坝全线挡水后，三峡工程提前两年发挥部分防洪效益。工程竣工后，三峡水库可为长江中下游提供221.5亿立方米的防洪库容，可将荆江河段的防洪标准由原来约十年一遇提高到百年一遇。遇到特大洪水时，配合运用荆江地区的蓄滞洪区分洪，可有效防止荆州河段发生干堤溃决的毁灭性灾害，为武汉等沿江重要城市的防洪保安提供保障。
二是提前一年发电，取得了良好的经济效益，对缓解华东、华中地区用电紧张状况发挥了重要作用。左岸电站14台机组提前一年投产发电，至2006年6月底，已累计发电1181.62亿度，实现收入297.53亿元，比初步设计方案分别增加379亿度和79.47亿元。大部分发电收入用于了三峡工程建设。
三是航运效益好于预期。2003年6月蓄水通航后，长江上游实现了万吨级船队通航，促进了运量的大幅度增长，降低了水运成本。2004年、2005年通过船闸的货物运量分别为4308万吨和4394万吨，比蓄水前增长了4倍多，接近初步设计报告预测的2030年5000万吨的水平。工程运行3年来，通过在枯水季节调节水库下泄流量，较好地解决了长江中游局部河段通航水深不足的问题。
此次审计也发现，一些中小合同项目没有严格执行招投标制度，部分单项工程监理工作比较薄弱，主要设备材料采购内控制度存在薄弱环节，质量事故责任追究制度未完全落实等。
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