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对于北京军区总医院附属八一儿童医院来说，连体兄弟的手术是一次综合考验，自从定下了手术的时间起，医院相关科室的医生们就提前进入了准备状态。在距离手术不到48小时的时候，由此次分体手术主刀医生牵头，骨科、外科、小儿外科和神经科以及药理科和护理部召开了一次专门针对手术细节以及如何应对突发情况的会议。来自这些科室的主任医师将从实际诊疗中以及论证中发现的疑点提供给了此次手术的主刀医生，以方便他提前做好手术中突发情况的应急工作。
记者从此次术前准备中得知，除了分体手术的主刀医生，北京军区总医院副院长、全军创伤骨科研究所所长孙天胜和两名助手外，此次分体手术将配备三套医护人员，每套医护人员都由3到5名监护医生和1名麻醉师组成。分体手术完成后，由两套医护人员专门对连体兄弟进行植皮并做皮瓣，而另一套医护班子则专门应对突发情况。医生表示，尽管医院从多方面对兄弟俩的身体进行了检查，但是影像学的检查必定与实际存在着误差，只有等手术刀切下去，才能真正见到内部的真实情况。所以对于这些未知情况也必须做好应对，另外再配一套抢救的医护班子也是必需的。
手术的方案得到了所有医生的认可，但护理部的医生此时也提出了一个顾虑，就是参加此次分体手术的医护人员数量庞大，如何做好消毒和抗感染成了关键。经多方研究，各科室医生一致同意除了做好每个参加者的消毒外，每套手术的医生要呆在指定的位置，不能随意穿越手术室或是走动，因为每个手术室的空气中细菌含量都不相同，这样做就能防止气体层流带来的菌群不平衡。
从手术的准备方案中可以看出，连体兄弟的手术并不是像人们想象的那样一刀切下去，而是先在连接的一面切出一个口，再根据连接的实际情况，在此面切出一定的深度后，再让兄弟俩翻个身，从另一面接着进行切割。对于这样的手术方式，也是很多手术中不曾出现的，所以对于兄弟俩如何翻身，医生们是最头疼的。因为切开了一面后，兄弟俩的血管或者是神经还是相连的，带着这些“管子”翻身而又不让它们变形或者是断裂，对于负责翻身的医生而言将是一个考验。
此外，分体手术中的用药以及术后的护理也是此次分体手术是否成功的一个重点。为了让兄弟俩渡过这道难关，药理部专门收集了他们所处环境的空气标本，以及他们的排泄物，分别做了细菌培养，验证出兄弟俩的身体害怕哪种细菌、哪种消炎药物适合他们的身体使用。
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